报告时间：2025年6月5日（周四）14:00
报告地点：莫干山校区生工楼C201天曲报告厅
报告题目：Developing New Binding Free Energy Methods for Accelerating New Drug Discovery
报告人：邓南杰
邓南杰博士现任纽约市佩斯大学戴森学院化学系终身副教授，费城天普大学兼职副教授。本科毕业于南京大学物理系，博士毕业于英国曼彻斯特大学物理化学专业。曾担任Accelrys Inc.公司高级研究科学家。目前专注于开发新计算化学方法助力新药研发，研究蛋白-配体、DNA-配体相互作用及蛋白质折叠等生物物理化学过程。已在Science, JACS等国际顶级期刊发表50余篇论文，参与撰写Springer学术专著1部，研究成果引用超2000次。多次受邀在美国化学学会年会等国际学术会议做报告。担任Scientific Reports编委及Frontiers in Molecular Biosciences审稿编辑。
报告摘要：在生物化学与生物物理领域，蛋白质、DNA与小分子的非共价缔合不仅是关键生化过程的基础，也是治疗性药物作用的核心机制。精确计算分子结合自由能与熵对该领域研究意义重大。本报告聚焦课题组五年内开发的系列创新方法：提出计算带电配体结合自由能的新平均力势（PMF）法；创新结合炼金变换与PMF策略，精准计算封闭结合位点带电配体结合自由能；基于玻尔兹曼 - 准谐振模型构建新终点评估法以计算结合熵。这些方法成功应用于阐释蛋白-配体、DNA-配体复合物及主体-客体体系的分子识别机制。在药物研发实践中，其可精准预测结合自由能与熵，助力命中化合物向先导化合物优化、化合物库排序，识别潜在药物分子，尤其适用于研发早期，能有效减轻实验负担，加速新药研发进程。